1.微波殺菌設備的時間短、速度快，微波能與食品以及細菌等微生物直接相互作用，在熱效應與非熱效應共同作用下，達到快速升溫殺菌作用，處理時間大大縮短，對各種物料的殺菌作用一般在3-5分鐘。 2.節約能源，由于是直接對食品進行作用處理，因此沒有額外的熱能損耗。 3.殺菌效果好，微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，可使其食品的表面和內部都受到作用，所以殺菌好。